Scientific internships, awards, membership in scientific societies:

Awards:

• Award of the Jagiellonian University Rector III degree for distinguished PhD thesis (2018)
• Winner of the J. Zurzycki Research Fellowship in the academic year 2014-2015; 2015-2016
• Winner of the pro-quality scholarship of the Rector of the Jagiellonian University in the academic year 2013/2014 i 2014/2015
• Winner of the Scientific Scholarship of the Rector of the Jagiellonian University in the years 2013/2014 i 2014/20152019/2020

Przynależność do towarzystw naukowych:

• European Academy of Allergy and Clinical Immunology – from 2021
• European Respiratory Society – from 2018
• Polish Society of Lung Diseases – from 2018
• Polish Biochemical Society – from 2015
• Polish Cell Biology Society – from 2014

Zainteresowania badawcze:

• Phenotypic transition of cells: fibroblasts into myofibroblasts (FMT), epithelial-mesenchymal transition (EMT), endothelial-mesenchymal transition (EndMT) during asthma and others fibrosis-related diseases;
• Mechanisms of intracellular signalling during phenotypic shifts (FMT, EMT, EndMT);
• Study of the antifibrotic properties of PPARs and their agonists, including new-generation PPAR agonists;
• The role of histone deacetylases and sirtuins during the regulation of phenotypic shifts of cells in asthma;
• Study of the antifibrotic properties of extracellular vesicles (EVs) during asthma progression and other fibrosis-related diseases;
• Function of connexins in the differentiation of cells in asthma remodeling, fibrosis-related diseases and cancers;
• Application of advanced models of in vitro cell cultures in research (EMTU, ALI model, cultures in 3D collagen gels or 3D fibrin-hyaluronic gels, cell-tissue cultures (cartilage tissue and chondrocytes);

Dydaktyka:

• Biologia komórki (WBT-165)
• Biologia komórki dla biochemików (WBT-336)
• Podstawy biologii komórki (WBT-621)
• Praktikum z biologii komórki (WBT-106)
• Praktikum z cytobiologii dla biofizyków (WBT-BFMK4.7)
• Praktikum z cytochemii (BCH-395)
• oraz pracownie licencjackie i magisterskie w Zakładzie Biologii Komórki

Publikacje:

1. Ferdek P, Krzysztofik D, Stopa K, Kusiak A, Paw M, Wnuk D, Jakubowska M (2022) When healing turns into killing - the pathophysiology of pancreatic and hepatic fibrosis. The Journal of Physiology, accepted manuscript. https://doi.org/10.1113/JP281135
2. Krzysiek-Maczka G, Targosz A, Wrobel T, Paw M, Szczyrk U, Opila J, Strzalka M, Wierdak M, Major P, Brzozowski T, Czyz J, Ptak-Belowska A. Time-extended exposure of gastric epithelial cells to secretome of Helicobacter pylori-activated fibroblasts induces reprogramming of gastric epithelium towards pre-cancerogenic and pro-invasive phenotype. Am J Cancer Res. 2022 Mar 15;12(3):1337-1371. PMID: 35411238
3. Paw M, Wnuk D, Nit K, Bobis-Wozowicz S, Szychowski R, Ślusarczyk A, Madeja Z, Michalik M (2021) SB203580—A Potent p38 MAPK Inhibitor Reduces the Profibrotic Bronchial Fibroblasts Transition Associated with Asthma. International Journal of Molecular Sciences, 22(23), 12790. https://doi.org/10.3390/ijms222312790
4. Paw M, Wnuk D, Jakieła B, Bochenek G, Sładek K, Madeja Z, Michalik M (2021) Responsiveness of human bronchial fibroblasts and epithelial cells from asthmatic and non-asthmatic donors to the transforming growth factor-β1 in epithelial-mesenchymal trophic unit model. BMC Molecular and Cell Biology 22:19. https://doi.org/10.1186/s12860-021-00356-8
5. Wnuk D, Lasota S, Paw M, Madeja Z, Michalik M (2020) Asthma-derived fibroblast to myofibroblast transition is enhanced in comparison to fibroblasts derived from non-asthmatic patients in 3D in vitro culture due to Smad2/3 signalling. Acta Biochim. Pol. 67. https://doi.org/10.18388/abp.2020_5412
6. Wnuk D, Paw M, Ryczek K, Bochenek G, Sładek K, Madeja Z, Michalik M (2020) Enhanced asthma-related fibroblast to myofibroblast transition is the result of profibrotic TGF-β/Smad2/3 pathway intensification and antifibrotic TGF-β/Smad1/5/(8)9 pathway  impairment. Sci. Rep. 10:16492. https://doi.org/10.1038/s41598-020-73473-7
7. Krzykawski, M.P., Krzykawska, R., Paw, M. Czyż J, Marcinkiewicz J. A novel in vitro model of metastasis supporting passive shedding hypothesis from murine pancreatic cancer Panc-02. Cytotechnology 71, 989–1002 (2019). https://doi.org/10.1007/s10616-019-00341-2
8. Paw M*, Wnuk D*, Kadziołka D, Sęk A, Lasota S, Czyż J, Madeja Z, Michalik M (2018) Fenofibrate reduces the asthma-related fibroblast-to-myofibroblast transition by TGF-β/Smad2/3 signaling attenuation and connexin 43-dependent phenotype destabilization. Int. J. Mol. Sci. 19. https://doi.org/10.3390/ijms19092571, *równorzędne współautorstwo 
9. Michalik M, Wójcik-Pszczoła K, Paw M, Wnuk D, Koczurkiewicz P, Sanak M, Pękala E, Madeja Z (2018) Fibroblast-to-myofibroblast transition in bronchial asthma. Cell. Mol. Life Sci. 75:3943–3961. https://doi.org/10.1007/s00018-018-2899-4
10. Paw M, Borek I, Wnuk D, Ryszawy D, Piwowarczyk K, Kmiotek K, Wojcik-Pszczoła KA, Pierzchalska M, Madeja Z, Sanak M, Błyszczuk P, Michalik M, Czyz J (2017) Connexin43 controls the myofibroblastic differentiation of bronchial fibroblasts from patients with asthma. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 57:100–110. https://doi.org/10.1165/rcmb.2015-0255OC
11. Piwowarczyk K., Paw M., Ryszawy D., Rutkowska-Zapała M., Madeja Z., Siedlar M., Czyż J. Connexin43high prostate cancer cells induce endothelial connexin43 up-regulation through the activation of intercellular ERK1/2-dependent signaling axis. Eur J Cell Biol. 2017; https://doi.org/10.1016/j.ejcb.2017.03.012.
12. Czyż J., Piwowarczyk K., Paw M., Luty M., Wróbel T., Catapano J., Madeja Z., Ryszawy D. Connexin-dependent intercellular stress signaling in tissue homeostasis and tumor development. Acta Biochim Pol 2017; https://doi.org/10.18388/abp.2017_1592
13. Galanty A, Koczurkiewicz P, Wnuk D, Paw M, Karnas E, Podolak I, Węgrzyn M, Borusiewicz M, Madeja Z, Czyż J, Michalik M (2017) Usnic acid and atranorin exert selective cytostatic and anti-invasive effects on human prostate and melanoma cancer cells. Toxicol. Vitr. 40:161–169. https://doi.org/10.1016/j.tiv.2017.01.008
14. Piwowarczyk K., Wybieralska E., Baran J., Borowczyk J., Rybak P., Kosińska M., Włodarczyk A.J., Michalik M., Siedlar M., Madeja Z., Dobrucki J., Reiss K., Czyż J. Fenofibrate enhances barier junction of endothelial continuum within the metastatic niche of prostate cancer cells. Expert Opin Ther Targets 2014; 12:1-14. https://doi.org/10.1517/14728222.2014.981153
15. Michalik M, Soczek E, Kosińska M, Rak M, Wójcik KA, Lasota S, Pierzchalska M, Czyż J, Madeja Z. (2013). Lovastatin-induced decrease of intracellular cholesterol level attenuates fibroblast-to-myofibroblast transition in bronchial fibroblasts derived from asthmatic patients. Eur J Pharmacol, 704(1-3):23-32. https://doi.org/10.1016/j.ejphar.2013.02.023

Projekty naukowe:

Kierownik:

1. Miniatura3 (2019/03/X/NZ3/01801), Polish National Science Centre: "The role of histone deacetylases during the epigenetic regulation of TGF-β1-induced phenotypic shifts of human bronchial fibroblasts into myofibroblasts in asthma ". Duration: 12.2019 – 12.2020.
2. Projekt dla Młodych Naukowców w ramach dotacji MNiSW 2021, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ: "Powiązania pomiędzy ekspresją i funkcją Cx43 a aktywnością przeciw-zwłóknieniowego szlaku białek Smad1/5/9 w przejściach fenotypowych fibroblastów oskrzelowych w miofibroblasty obserwowanych w astmie". Okres realizacji: 2021-2022
3. Projekt dla Młodych Naukowców w ramach dotacji MNiSW 2018, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ: "Mechanizmy działania fenofibratu na przejścia fenotypowe fibroblastów oskrzelowych w miofibroblasty towarzyszące rozwojowi astmy". Okres realizacji: 2018-2020
4. Projekt dla Młodych Naukowców w ramach dotacji MNiSW 2015, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ: "Rola mikrofragmentów komórkowych w regulacji różnicowania fibroblastów w miofibroblasty w czasie rozwoju astmy oskrzelowej”; Okres realizacji: 2015-2016
5. Projekt dla Młodych Naukowców w ramach dotacji MNiSW 2014, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ:„Oddziaływania między TGF-β1 i Cx43 w rozwoju astmy oskrzelowej”. Okres realizacji: 2014-2015

Główny wykonawca:

1. OPUS (NCN/2015/17/B/NZ3/02248), Narodowe Centrum Nauki – kierownik: dr hab. Marta Michalik, prof. UJ: Fenotypowe przejścia fibroblastów oskrzelowych w miofibroblasty – rola zróżnicowanej aktywacji szlaku TGF-beta/Smad w komórkach pochodzących od astmatyków i osób niechorujących na astmę oskrzelową – badania in vitro w modelu 2D, 3D i EMTU. Okres realizacji: 06.2016 – 12.2019. Post-doc.
2. ARTHEC Sp. z o.o. - badania zlecone: „Optymalizacja i walidacja procesu otrzymywania fragmentu tkanki chrzęstnej, uzyskanej na drodze kombinowanej hodowli fragmentów tkanki i chondrocytów”. Okres realizacji: 02.2020-03.2022, kierownik w UJ: prof. dr hab. Justyna Drukała.

Wykonawca:

1. SONATA NCN 2016/23/D/NZ3/01310; kierownik projektu: dr Sylwia Bobis-Wozowicz; “Wpływ hipoksji na charakterystykę molekularną oraz potencjał biologiczny, w tym zdolność do regeneracji serca, pęcherzyków zewnątrzkomórkowych wydzielanych przez ludzkie indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste.” Okres realizacji: 2019-2021.
2. HOMING PLUS/2013-7/3; kierownik projektu: dr Sylwia Bobis-Wozowicz; „Stem cell-derieved microvesicles as carriers of designer nucleases for genome editing”; Fundacja na rzecz Nauki Polskiej. Okres realizacji: 2013-2015.
3. OPUS NCN 2011/01/B/NZ3/00004; kierownik projektu: dr hab. Jarosław Czyż; „Analizy interakcji między komórkami raka prostaty i układu odpornościowego a śródbłonkiem w obrębie "niszy metastatycznej". Okres realizacji: 2011-2014.

Projekty naukowe:

Kierownik:

1. Miniatura3 (2019/03/X/NZ3/01801), Narodowe Centrum Nauki: "Rola deacetylaz histonowych w epigenetycznej regulacji indukowanych przez TGF-β1 przejść fenotypowych ludzkich fibroblastów oskrzelowych w miofibroblasty w astmie". Okres realizacji: 12.2019 – 12.2020.
2. Projekt dla Młodych Naukowców w ramach dotacji MNiSW 2021, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ: "Powiązania pomiędzy ekspresją i funkcją Cx43 a aktywnością przeciw-zwłóknieniowego szlaku białek Smad1/5/9 w przejściach fenotypowych fibroblastów oskrzelowych w miofibroblasty obserwowanych w astmie". Okres realizacji: 2021-2022
3. Projekt dla Młodych Naukowców w ramach dotacji MNiSW 2018, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ: "Mechanizmy działania fenofibratu na przejścia fenotypowe fibroblastów oskrzelowych w miofibroblasty towarzyszące rozwojowi astmy". Okres realizacji: 2018-2020
4. Projekt dla Młodych Naukowców w ramach dotacji MNiSW 2015, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ: "Rola mikrofragmentów komórkowych w regulacji różnicowania fibroblastów w miofibroblasty w czasie rozwoju astmy oskrzelowej”; Okres realizacji: 2015-2016
5. Projekt dla Młodych Naukowców w ramach dotacji MNiSW 2014, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ:„Oddziaływania między TGF-β1 i Cx43 w rozwoju astmy oskrzelowej”. Okres realizacji: 2014-2015

Główny wykonawca:

1. OPUS (NCN/2015/17/B/NZ3/02248), Narodowe Centrum Nauki – kierownik: dr hab. Marta Michalik, prof. UJ: Fenotypowe przejścia fibroblastów oskrzelowych w miofibroblasty – rola zróżnicowanej aktywacji szlaku TGF-beta/Smad w komórkach pochodzących od astmatyków i osób niechorujących na astmę oskrzelową – badania in vitro w modelu 2D, 3D i EMTU. Okres realizacji: 06.2016 – 12.2019. Post-doc.
2. ARTHEC Sp. z o.o. - badania zlecone: „Optymalizacja i walidacja procesu otrzymywania fragmentu tkanki chrzęstnej, uzyskanej na drodze kombinowanej hodowli fragmentów tkanki i chondrocytów”. Okres realizacji: 02.2020-03.2022, kierownik w UJ: prof. dr hab. Justyna Drukała.

Wykonawca:

1. SONATA NCN 2016/23/D/NZ3/01310; kierownik projektu: dr Sylwia Bobis-Wozowicz; “Wpływ hipoksji na charakterystykę molekularną oraz potencjał biologiczny, w tym zdolność do regeneracji serca, pęcherzyków zewnątrzkomórkowych wydzielanych przez ludzkie indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste.” Okres realizacji: 2019-2021.
2. HOMING PLUS/2013-7/3; kierownik projektu: dr Sylwia Bobis-Wozowicz; „Stem cell-derieved microvesicles as carriers of designer nucleases for genome editing”; Fundacja na rzecz Nauki Polskiej. Okres realizacji: 2013-2015.
3. OPUS NCN 2011/01/B/NZ3/00004; kierownik projektu: dr hab. Jarosław Czyż; „Analizy interakcji między komórkami raka prostaty i układu odpornościowego a śródbłonkiem w obrębie "niszy metastatycznej". Okres realizacji: 2011-2014.